
Number and proportion of individuals for each plastome haplotype.
Haplotype | Variation No. |
Country of origin | Germplasm type | Total (%) | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S2 | S9 | S6 | S10 | S7 | S11 | S1 | S5 | S3 | S4 | K | C | J | R | Cultivatedginseng | Wildginseng | ||||
A | C | A | G | T | A | A | G | C | G | A | 91 | 23 | 4 | 1 | 98 | 21 | 119 (60.1) | ||
B | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | 23 | 2 | - | 8 | 24 | 9 | 33 (16.7) | ||
B’ | T | G | · | · | · | · | · | · | · | · | 10 | - | - | - | 6 | 4 | 10 (5.1) | ||
C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | 5 | 1 | - | - | 5 | 1 | 6 (3.0) | ||
D | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | 5 | 1 | - | - | 4 | 2 | 6 (3.0) | ||
E | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | 2 | - | 2 | - | 4 | - | 4 (2.0) | ||
F | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | 2 | 1 | - | - | 3 | - | 3 (1.5) | ||
G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | 2 | - | - | - | 2 | - | 2 (1.0) | ||
H | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | 1 | - | - | - | 1 | - | 1 (0.5) | ||
I | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | 7 | - | 1 | - | 7 | 1 | 8 (4.0) | ||
J | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | 2 | - | 1 | - | 2 | 1 | 3 (1.5) | ||
IJ | · | · | · | · | · | · | · | · | T | C | 2 | 1 | - | - | 3 | - | 3 (1.5) |
Grayboxes represent the SNP positions where mutations occurred.
z)Variation number shown in Fig. 1.
C: China, J: Japan, K: Korea, R: Russia.